Ce premier tome raconte l'origine du projet des super soldat, les spartans.
Jhon est arraché de chez lui dès l'age de 6 ans et est cloné avec plusieurs autres dizaines d'enfants, notement Kelly, une fille capable de courir à une vitesse allucinante, Sam, Fred, Linda et d'auters, qui sont soumis à un entrainement intensif. Ils vont subir des modifications corporelles et certains ne s'en sortiront pas.
De nombreuses missions les ont confontés aux forces rebelles. Mais aujourd'hui, un nouvel ennemies, plus fort, plus puissant détruit colonies après colonies, monde après monde, Les Covenants. Ils forcent les hommes à reculer vers la Terre.
Mais heureusement, un monde forteresse, une colonies des humains, abritent les Spartans survivants, Reach. Les covenants s'attaquent à Reach et malgrès une lutte sans merci opposant les hommes à cette alliance de plusieurs races (: Elite, Grunt, Jackal et Hunter)
Les forces du CSNU voient leurs troupes tomber les unes après les autres et oblige un vaisseau, Le pillar of Automn, à fuir avec le dernier specimen de sa race: Jhon Spartan 117, l'Adjudant.
Le vaisseau se retrouve perdu dans l'espace avec pour seul but, celui de survivre.
Enfin, ils tombent sur une chose qui va les surprendre. Un anneau de plusieurs milliers de kilometres créer par une race aujourd'hui éteinte (qu'on estime etre les ancetre des hommes) Les Forunners. Cet Halo possède de nombreux secret qui va contraindre au Spartan 117 de les découvrir mais aussi de les fuires.